La región conocida como costa sur concentra alrededor del 20% del territorio del estado, con 22 municipios. Se trata de una zona de marcada vocación agrícola, pecuaria y forestal, que se caracteriza por su biodiversidad y la riqueza de sus recursos naturales, así como por los grupos indígenas nahuas que habitan en la sierra.

El Centro Universitario tiene la misión de atender la demanda de servicios educativos que hay en los siguientes municipios de Jalisco: Atengo, Atenguillo, Autlán de Navarro, Ayutla, Casimiro Castillo, Cihuatlán, Cuautitlán  de García Barragán, Chiquilistlán, Cuautla, Ejutla, El Grullo, El Limón, Juchitlán, La Huerta, Villa de Purificación, Mixtlán, Talpa de Allende, Tecolotlán, Tenamaxtlán, Tonaya, Tuxcacuesco, Unión de Tula.

El centro universitario se conforma por dos divisiones: Estudios Sociales y Económicos, Desarrollo Regional y ocho departamentos: Ciencias de la Administración, Contaduría Pública, Ecología y Recursos Naturales, Estudios Jurídicos, Estudios Turísticos, Ingenierías, Producción Agrícola, Estudios para el Desarrollo Sustentable de zonas costeras.

Ofrece 22 programas docentes: 2 de técnico superior universitario, 12 de licenciatura, 7 de maestría y 1 doctorado. La población escolar es de 2,641 alumnos, 206 en Técnico Superior Universitario y 2,381 en licenciatura, 43 en maestría y 11 en doctorado. El personal académico que atiende esta matrícula es de 304, de los cuales 135 son profesores de tiempo completo.

En generación y aplicación del conocimiento, se cuenta con el prestigiado Instituto de Manantlán de Ecología y Conservación de la Biodiversidad (IMECBIO). La plantilla de  académicos dedicados a la investigación es de 74 profesores-investigadores, 10 de éstos pertenecen al SNI.

Como apoyo a las actividades académicas, el Centro Universitario posee una biblioteca, con 24,835 títulos (42,011 volúmenes), y cuenta con 1,182 equipos de cómputo para servicio académico.