El CUCSH se estructuró sobre la base de las antiguas facultades de Derecho (fundada en 1792) y la de Filosofía y Letras (1957), así como de centros de investigación como el Instituto de Estudios Sociales, el Instituto de Geografía y Estadística (1941), el Centro de Investigaciones Sociales y Económicas (1961) y el Centro de Estudios de la Información y la Comunicación (1986). Su campus, construido en los años 1960, constituye una muestra excelente de arquitectura contemporánea regional.

El Centro Universitario se conforma por cinco divisiones: Estudios de la Cultura, Estudios de Estado y Sociedad, Estudios Políticos y Sociales, Estudios Históricos y Humanos y Estudios Jurídicos y los 24 departamentos siguientes: Derecho Privado, Derecho Público, Derecho Social, Desarrollo Social, Disciplinas Afines al Derecho, Estudios de la Comunicación Social, Estudios en Educación, Estudios Ibéricos y Latinoamericanos, Estudios Internacionales, estudios Políticos, Estudios sobre Movimientos Sociales, Estudios Socio-Urbanos, Filosofía, Geografía y Ordenación Territorial, Historia, Lenguas Modernas, Letras, Sociología, Trabajo Social, Estudios Literarios, Cultura Regional, Estudios Mesoamericanos y Mexicanos, Estudios del Pacífico y Estudios en Lenguas Indígenas.

Ofrece 35 programas docentes, de los cuales 16 son de licenciatura, 1 de especialidad, 14 maestrías y 4 de doctorado. La población escolar total que atiende es de 9,204 alumnos, 8,883 en licenciatura, 265 maestrías y 56 de doctorado. El personal académico que atiende esta matrícula es de 1,158 de los cuales 677 son profesores de tiempo completo.

En generación y aplicación del conocimiento, el centro universitario cuenta con los institutos y centros de investigación siguientes: Estudios de Género, Estudios Estratégicos para el Desarrollo, Estudios sobre el Cambio y las Instituciones, Estudios Urbanos, Estudios Cinematográficos. La plantilla de académicos dedicados a la investigación es de 415 profesores-investigadores de tiempo completo y 4 de medio tiempo, 144 de éstos pertenecen al SNI y 1 al SNCA.

Como apoyo a las actividades académicas, el centro universitario cuenta con 15 bibliotecas, con 136,143 títulos (175,084 volúmenes); además dispone de 2,375 equipos de cómputo para servicio académico.